Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E130114P18RikF6S0S7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E130114P18RikF6S0S7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms