Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
2610001J05RikF2Z3Y9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms