Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20518E9Q548 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms