Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm2237E9Q501 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2237E9Q501 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm2237E9Q501 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms