Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms