Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms