Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm20425E9Q035 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm20425E9Q035 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms