Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp944E9PUS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp944E9PUS4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms