Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt2E9PUL5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt2E9PUL5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt2E9PUL5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms