Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC035947B2RQY6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC035947B2RQY6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC035947B2RQY6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms