Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp42B2RQC2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp42B2RQC2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp42B2RQC2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms