Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdr2lA2A6T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms