Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm27029A2A4P4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm27029A2A4P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm27029A2A4P4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms