Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cc2d2bA0A286YDU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cc2d2bA0A286YDU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cc2d2bA0A286YDU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cc2d2bA0A286YDU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms