Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
1700019A02RikA0A087WPV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms