Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z7

Klf5, Krueppel-like factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf5Q9Z0Z7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf5Q9Z0Z7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf5Q9Z0Z7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf5Q9Z0Z7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms