Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Cldn13Q9Z0S4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn13Q9Z0S4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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