Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bgrQ9WUZ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms