Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stub1Q9WUD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms