Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd6ipQ9WU78 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd6ipQ9WU78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd6ipQ9WU78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms