Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv2Q9WTR1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv2Q9WTR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms