Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sema6cQ9WTM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6cQ9WTM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms