Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhx6Q9R1R0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lhx6Q9R1R0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lhx6Q9R1R0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms