Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt6Q9R0N8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syt6Q9R0N8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms