Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc3Q9QZC1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc3Q9QZC1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms