Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Six6Q9QZ28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Six6Q9QZ28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Six6Q9QZ28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms