Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SpastQ9QYY8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SpastQ9QYY8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms