Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxe3Q9QY14 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxe3Q9QY14 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxe3Q9QY14 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms