Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lsm4Q9QXA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm4Q9QXA5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm4Q9QXA5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms