Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf19Q9JLL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms