Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgn5Q9JL35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms