Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Extl1Q9JKV7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Extl1Q9JKV7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Extl1Q9JKV7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms