Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Akip1Q9JJR5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Akip1Q9JJR5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms