Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacna1fQ9JIS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna1fQ9JIS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms