Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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Cldn19Q9ET38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Cldn19Q9ET38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Cldn19Q9ET38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn19Q9ET38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Cldn19Q9ET38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Cldn19Q9ET38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Cldn19Q9ET38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Cldn19Q9ET38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Cldn19Q9ET38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn19Q9ET38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms