Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dkc1Q9ESX5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkc1Q9ESX5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms