Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Aff4Q9ESC8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aff4Q9ESC8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Aff4Q9ESC8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aff4Q9ESC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aff4Q9ESC8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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