Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a4bQ9ES61 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a4bQ9ES61 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4bQ9ES61 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4bQ9ES61 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms