Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snap29Q9ERB0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snap29Q9ERB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snap29Q9ERB0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms