Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfcp2Q9ERA0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfcp2Q9ERA0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tfcp2Q9ERA0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfcp2Q9ERA0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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