Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx6Q9ER75 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx6Q9ER75 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx6Q9ER75 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms