Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cpsf1Q9EPU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cpsf1Q9EPU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cpsf1Q9EPU4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cpsf1Q9EPU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1593.6 ms