Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Swt1Q9DBQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Swt1Q9DBQ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Swt1Q9DBQ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms