Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem239Q9DA47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem239Q9DA47 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms