Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sgf29Q9DA08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sgf29Q9DA08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms