Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SlirpQ9D8T7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlirpQ9D8T7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms