Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D8N1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D8N1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms