Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8L0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8L0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms