Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alkbh4Q9D8F1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms