Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl4Q9D8E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl4Q9D8E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms