Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AplfQ9D842 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AplfQ9D842 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms